La Subdirección Nacional de Museos es la unidad destinada a la promoción del desarrollo armónico y sostenido de los museos de Chile. Tiene un campo de acción directa referida a 24 museos regionales y especializados desde Antofagasta a Puerto Williams, incluyendo Rapa Nui. También busca transformarse en una entidad capaz de coordinar, asesorar y apoyar el desarrollo de los museos chilenos, y constituirse en un centro de referencia en materias museológicas para instituciones nacionales y latinoamericanas que conservan patrimonio.